Игра сделана в необычном, как для покемонов, жанре — Tower Defense, или Защитные Башни. Дикие покемоны атакуют лабораторию профессора Оука. Они двигаются к ней по длинной извилистой тропинке и если добираются к своей цели, то снижают особый запас энергии, соответствующий цифрам рядом с Грейт Боллом в игровом меню. Чтобы остановить их, игра даёт вам прирученных покемонов, которых надо расставлять вдоль дорожки. Каждый из них имеет свой стиль атаки и особенности. Например, Пикачу действует только на наземных существ, поражая их током. На установку и апгрейд покемонов по ходу игры тратятся бриллианты. Накапливаются они уничтожением врагов. Постепенно в вашей армии появляются бойцы новых типов.
